學(xué)院設(shè)有作物學(xué)博士后流動站、作物學(xué)一級學(xué)科博（碩）士點，作物栽培學(xué)與耕作學(xué)、作物遺傳育種、植物生物技術(shù)、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全與環(huán)境、農(nóng)業(yè)信息化技術(shù)、區(qū)域農(nóng)業(yè)發(fā)展、作物生產(chǎn)裝備及其自動化等7個二級學(xué)科博（碩）士點和生態(tài)學(xué)二級學(xué)科碩士點，以及農(nóng)業(yè)推廣碩士專業(yè)學(xué)位點（含作物、農(nóng)村與區(qū)域發(fā)展2個培養(yǎng)領(lǐng)域）；學(xué)院設(shè)有農(nóng)學(xué)、農(nóng)村區(qū)域發(fā)展2個本科專業(yè)和農(nóng)學(xué)（農(nóng)業(yè)信息技術(shù)）專業(yè)方向，其中農(nóng)學(xué)專業(yè)為江蘇省首批品牌專業(yè)和國家特色專業(yè)建設(shè)點，農(nóng)村區(qū)域發(fā)展專業(yè)是揚州大學(xué)特色專業(yè)建設(shè)點。
重點學(xué)科：作物栽培學(xué)與耕作學(xué)，為國家級重點學(xué)科，發(fā)源于1902年著名實業(yè)家、教育家張謇先生創(chuàng)辦的江海農(nóng)學(xué)堂。20世紀(jì)60年代開始招收研究生，1981年獲碩士學(xué)位授予權(quán)，1998年獲博士學(xué)位授予權(quán)，2000年獲作物學(xué)一級學(xué)科博士學(xué)位授予權(quán)，2003年獲準(zhǔn)設(shè)立作物學(xué)博士后流動站。1986年、1994年、2001年相繼被確定為江蘇省重點學(xué)科，2006年被評為國家級重點學(xué)科。其中，農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全及其控制方向于2005年被遴選為江蘇省重點（交叉）學(xué)科。1996年后，一直為中國作物學(xué)會栽培專業(yè)委員會掛靠單位。